MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020127	AT	3	6	363	368	50 %	50 %	0 %	0 %	442555262
2	NC_020127	ACA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555262
3	NC_020127	A	6	6	404	409	100 %	0 %	0 %	0 %	442555262
4	NC_020127	TAG	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555262
5	NC_020127	ATT	2	6	474	479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555262
6	NC_020127	AGG	2	6	564	569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555262
7	NC_020127	TAA	3	9	639	647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555262
8	NC_020127	ACA	2	6	648	653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555262
9	NC_020127	AAG	2	6	696	701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
10	NC_020127	AT	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	442555262
11	NC_020127	TTACCT	2	12	727	738	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442555262
12	NC_020127	TGT	2	6	798	803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
13	NC_020127	TAA	2	6	813	818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555262
14	NC_020127	TGC	3	9	828	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555262
15	NC_020127	GGA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555262
16	NC_020127	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	442555262
17	NC_020127	AAGG	2	8	1046	1053	50 %	0 %	50 %	0 %	442555262
18	NC_020127	T	6	6	1092	1097	0 %	100 %	0 %	0 %	442555262
19	NC_020127	AGA	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
20	NC_020127	GTT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
21	NC_020127	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	442555262
22	NC_020127	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	442555262
23	NC_020127	AAAGC	2	10	1414	1423	60 %	0 %	20 %	20 %	442555262
24	NC_020127	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555262
25	NC_020127	TAT	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555262
26	NC_020127	TGT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
27	NC_020127	T	6	6	1604	1609	0 %	100 %	0 %	0 %	442555262
28	NC_020127	AGA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
29	NC_020127	AAAG	2	8	1718	1725	75 %	0 %	25 %	0 %	442555262
30	NC_020127	CATT	2	8	1779	1786	25 %	50 %	0 %	25 %	442555262
31	NC_020127	TTA	2	6	1824	1829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555263
32	NC_020127	TTGC	2	8	1844	1851	0 %	50 %	25 %	25 %	442555263
33	NC_020127	GAT	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
34	NC_020127	TTG	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
35	NC_020127	AAC	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555263
36	NC_020127	AG	3	6	2091	2096	50 %	0 %	50 %	0 %	442555263
37	NC_020127	TGCTTT	2	12	2106	2117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442555263
38	NC_020127	GTA	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
39	NC_020127	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
40	NC_020127	TCT	2	6	2281	2286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
41	NC_020127	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555263
42	NC_020127	TGT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
43	NC_020127	GAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555263
44	NC_020127	TA	3	6	2396	2401	50 %	50 %	0 %	0 %	442555263
45	NC_020127	AAT	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555263
46	NC_020127	CCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555263
47	NC_020127	T	6	6	2489	2494	0 %	100 %	0 %	0 %	442555263
48	NC_020127	TGC	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555263
49	NC_020127	TTC	2	6	2544	2549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
50	NC_020127	CCT	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555263
51	NC_020127	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555263
52	NC_020127	T	7	7	2584	2590	0 %	100 %	0 %	0 %	442555263
53	NC_020127	GTAATA	2	12	2609	2620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442555263
54	NC_020127	T	7	7	2661	2667	0 %	100 %	0 %	0 %	442555263
55	NC_020127	TTC	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
56	NC_020127	TAA	2	6	2711	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555263
57	NC_020127	TGT	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
58	NC_020127	T	6	6	2748	2753	0 %	100 %	0 %	0 %	442555263
59	NC_020127	AGT	2	6	2766	2771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
60	NC_020127	TTGTT	2	10	3117	3126	0 %	80 %	20 %	0 %	442555264
61	NC_020127	T	6	6	3143	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	442555264
62	NC_020127	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555264
63	NC_020127	A	7	7	3200	3206	100 %	0 %	0 %	0 %	442555264
64	NC_020127	CACAAG	2	12	3277	3288	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	442555264
65	NC_020127	T	6	6	3323	3328	0 %	100 %	0 %	0 %	442555264
66	NC_020127	TGA	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555265
67	NC_020127	T	7	7	3488	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	442555265
68	NC_020127	TTA	2	6	3533	3538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555265
69	NC_020127	TAA	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
70	NC_020127	T	7	7	3693	3699	0 %	100 %	0 %	0 %	442555265
71	NC_020127	TGG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555265
72	NC_020127	ACA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555265
73	NC_020127	GAA	2	6	3904	3909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555265
74	NC_020127	ATT	3	9	3994	4002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555265
75	NC_020127	TAA	2	6	4007	4012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
76	NC_020127	ATAAA	2	10	4037	4046	80 %	20 %	0 %	0 %	442555265
77	NC_020127	A	7	7	4044	4050	100 %	0 %	0 %	0 %	442555265
78	NC_020127	GTA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555265
79	NC_020127	A	6	6	4091	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	442555265
80	NC_020127	TATT	2	8	4130	4137	25 %	75 %	0 %	0 %	442555265
81	NC_020127	GTT	2	6	4141	4146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555265
82	NC_020127	TAA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
83	NC_020127	A	6	6	4198	4203	100 %	0 %	0 %	0 %	442555265
84	NC_020127	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
85	NC_020127	CAC	3	9	4369	4377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555266
86	NC_020127	AAGAGG	2	12	4382	4393	50 %	0 %	50 %	0 %	442555266
87	NC_020127	CAC	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555266
88	NC_020127	CAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
89	NC_020127	CAG	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555266
90	NC_020127	TCC	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555266
91	NC_020127	TCA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
92	NC_020127	TAC	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
93	NC_020127	AG	3	6	4831	4836	50 %	0 %	50 %	0 %	442555266
94	NC_020127	A	6	6	4859	4864	100 %	0 %	0 %	0 %	442555266
95	NC_020127	ATA	2	6	4878	4883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555266
96	NC_020127	GAA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555267
97	NC_020127	TA	3	6	5625	5630	50 %	50 %	0 %	0 %	442555267
98	NC_020127	A	6	6	5641	5646	100 %	0 %	0 %	0 %	442555267
99	NC_020127	ATG	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555267
100	NC_020127	TTAT	2	8	5681	5688	25 %	75 %	0 %	0 %	442555267
101	NC_020127	GGT	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555267
102	NC_020127	TATTT	2	10	5797	5806	20 %	80 %	0 %	0 %	442555267
103	NC_020127	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555267
104	NC_020127	T	6	6	5885	5890	0 %	100 %	0 %	0 %	442555267
105	NC_020127	T	6	6	6024	6029	0 %	100 %	0 %	0 %	442555267
106	NC_020127	GTAGT	2	10	6051	6060	20 %	40 %	40 %	0 %	442555267
107	NC_020127	TTG	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
108	NC_020127	ATT	3	9	6179	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
109	NC_020127	A	6	6	6202	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	442555267
110	NC_020127	CTGTT	2	10	6267	6276	0 %	60 %	20 %	20 %	442555267
111	NC_020127	T	6	6	6275	6280	0 %	100 %	0 %	0 %	442555267
112	NC_020127	TCT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555267
113	NC_020127	GATG	2	8	6306	6313	25 %	25 %	50 %	0 %	442555267
114	NC_020127	A	6	6	6368	6373	100 %	0 %	0 %	0 %	442555267
115	NC_020127	TTG	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
116	NC_020127	ACT	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555267
117	NC_020127	AAC	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
118	NC_020127	ATT	2	6	6584	6589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
119	NC_020127	CAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555267
120	NC_020127	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
121	NC_020127	ATT	2	6	6695	6700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
122	NC_020127	TGT	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
123	NC_020127	ACAAA	2	10	6824	6833	80 %	0 %	0 %	20 %	442555267
124	NC_020127	TAT	2	6	6937	6942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
125	NC_020127	CAAGT	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	442555267
126	NC_020127	TAG	3	9	7008	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555267
127	NC_020127	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
128	NC_020127	CAA	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
129	NC_020127	AAG	2	6	7113	7118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555267
130	NC_020127	AG	3	6	7745	7750	50 %	0 %	50 %	0 %	442555268
131	NC_020127	TCT	2	6	7774	7779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555268
132	NC_020127	CAT	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555268
133	NC_020127	AAT	2	6	7860	7865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555268
134	NC_020127	TA	3	6	9648	9653	50 %	50 %	0 %	0 %	442555269
135	NC_020127	ATA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
136	NC_020127	ATA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
137	NC_020127	T	6	6	9786	9791	0 %	100 %	0 %	0 %	442555269
138	NC_020127	T	7	7	9797	9803	0 %	100 %	0 %	0 %	442555269
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253	NC_020127	ATT	2	6	15254	15259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555272
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259	NC_020127	TTGA	2	8	15399	15406	25 %	50 %	25 %	0 %	442555272
260	NC_020127	T	6	6	15427	15432	0 %	100 %	0 %	0 %	442555272
261	NC_020127	ACC	2	6	15448	15453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555272
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263	NC_020127	TTG	2	6	15499	15504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555272
264	NC_020127	GAG	2	6	15528	15533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555272
265	NC_020127	GA	3	6	15562	15567	50 %	0 %	50 %	0 %	442555272
266	NC_020127	CT	3	6	15583	15588	0 %	50 %	0 %	50 %	442555273
267	NC_020127	TCT	2	6	15605	15610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555273
268	NC_020127	TTC	2	6	15642	15647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555273
269	NC_020127	GTA	2	6	15663	15668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555273
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271	NC_020127	CAA	2	6	15938	15943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555273
272	NC_020127	TTG	2	6	15954	15959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555273
273	NC_020127	TCT	2	6	16006	16011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555273
274	NC_020127	ATA	2	6	16021	16026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555273
275	NC_020127	TCT	2	6	16029	16034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555273
276	NC_020127	GCA	2	6	16090	16095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555273
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279	NC_020127	AT	3	6	16201	16206	50 %	50 %	0 %	0 %	442555273
280	NC_020127	T	6	6	16217	16222	0 %	100 %	0 %	0 %	442555273
281	NC_020127	AT	4	8	16238	16245	50 %	50 %	0 %	0 %	442555273
282	NC_020127	CAT	2	6	16307	16312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555273
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284	NC_020127	ATG	2	6	16433	16438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555273
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286	NC_020127	AGCA	2	8	16455	16462	50 %	0 %	25 %	25 %	442555273
287	NC_020127	AAG	2	6	16495	16500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555273
288	NC_020127	AATATC	2	12	16545	16556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442555273
289	NC_020127	TTG	2	6	16575	16580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555273
290	NC_020127	GAA	2	6	16607	16612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555273
291	NC_020127	T	7	7	16622	16628	0 %	100 %	0 %	0 %	442555273
292	NC_020127	AGG	2	6	16684	16689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555273
293	NC_020127	GAT	2	6	16736	16741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555273
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299	NC_020127	TCGA	2	8	16965	16972	25 %	25 %	25 %	25 %	442555274
300	NC_020127	GTT	2	6	17010	17015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555274
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303	NC_020127	TAG	2	6	17096	17101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555274
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313	NC_020127	TA	3	6	17708	17713	50 %	50 %	0 %	0 %	442555275
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315	NC_020127	A	6	6	17720	17725	100 %	0 %	0 %	0 %	442555275
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320	NC_020127	GTT	2	6	17891	17896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555275
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345	NC_020127	GTT	2	6	18636	18641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555276
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381	NC_020127	AT	3	6	20659	20664	50 %	50 %	0 %	0 %	442555277
382	NC_020127	TTA	2	6	20971	20976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555278
383	NC_020127	T	6	6	20989	20994	0 %	100 %	0 %	0 %	442555278
384	NC_020127	T	6	6	21003	21008	0 %	100 %	0 %	0 %	442555278
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387	NC_020127	AC	3	6	21104	21109	50 %	0 %	0 %	50 %	442555278
388	NC_020127	CAC	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555278
389	NC_020127	AATT	2	8	21151	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	442555278
390	NC_020127	TCT	2	6	21170	21175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555278
391	NC_020127	AAT	2	6	21184	21189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555278
392	NC_020127	AGA	2	6	21338	21343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555278
393	NC_020127	GAA	2	6	21360	21365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555278
394	NC_020127	AAC	2	6	21372	21377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555278
395	NC_020127	T	7	7	21393	21399	0 %	100 %	0 %	0 %	442555278
396	NC_020127	ATA	2	6	21482	21487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555278
397	NC_020127	CTA	2	6	21516	21521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555279
398	NC_020127	ATC	2	6	21600	21605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555279
399	NC_020127	ACG	2	6	21633	21638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555279
400	NC_020127	T	7	7	21683	21689	0 %	100 %	0 %	0 %	442555279
401	NC_020127	AAG	2	6	21759	21764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555279
402	NC_020127	TGA	2	6	21766	21771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555279
403	NC_020127	T	7	7	21842	21848	0 %	100 %	0 %	0 %	442555279
404	NC_020127	TCA	2	6	21865	21870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555279
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422	NC_020127	AT	3	6	22656	22661	50 %	50 %	0 %	0 %	442555280
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495	NC_020127	TCC	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555283
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498	NC_020127	T	7	7	25889	25895	0 %	100 %	0 %	0 %	442555283
499	NC_020127	TGC	2	6	26033	26038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555283
500	NC_020127	T	8	8	26206	26213	0 %	100 %	0 %	0 %	442555283

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